心叶小檗，落叶灌木，高2-3米。
老枝黑灰色，幼枝棕褐色，具稀疏黑色疣点，无毛，具条棱；
茎刺单生或缺如，长约1厘米，暗灰色。
叶纸质，倒心形或近楔形，长8-14毫米，宽6-9毫米，先端微凹或平截，基部楔形，上面绿色，中脉和侧脉微隆起，背面浅绿色，中脉明显隆起，侧脉微隆起，两面网脉隆起，无毛，叶缘平展，全缘；
叶柄长1-2毫米。
总状花序具6-12朵花，有时花在花序轴上部近轮列，长1.6-2.2厘米，总梗长5-10毫米，无毛；
苞片长约1.5毫米，披针形；
花未见。
果梗长约6毫米，无毛；
浆果椭圆形，长8-9毫米，直径5-6毫米，顶端具明显宿存花柱，被白粉；
含种子2枚。
果期8月。