穿心莲,一年生草本。
茎高50-80厘米,4棱,下部多分枝,节膨大。
叶卵状矩圆形至矩圆状披针形,长4-8厘米,宽1-2.5厘米,顶端略钝。
花序轴上叶较小,总状花序顶生和腋生,集成大型圆锥花序;
苞片和小苞片微小,长约1毫米;
花萼裂片三角状披针形,长约3毫米,有腺毛和微毛;
花冠白色而小,下唇带紫色班纹,长约12毫米,外有腺毛和短柔毛,2唇形,上唇微2裂,下唇3深裂,花冠筒与唇瓣等长;
雄蕊2,花药2室,一室基部和花丝一侧有柔毛。
蒴果扁,中有一沟,长约10毫米,疏生腺毛;
种子12粒,四方形,有皱纹。