仲巴蝇子草，多年生草本，高10-20厘米，全株密被柔毛和稀疏腺毛。
根细，圆锥状，稍木质。
茎丛生，不分枝。
基生叶莲座状，叶片倒披针形，长3-5厘米，宽3-6毫米，顶端钝，基部渐狭成长柄状，两面被短柔毛；
茎生叶2-3对，叶片披针形，比基生叶稍小，基部宽楔形，无柄。
花 (1-) 3-8朵；
苞片披针形，密被腺毛；
花梗长2-8毫米，密被灰白色柔毛；
花萼狭钟形，长0.7-13毫米，密被腺毛，萼齿三角形，顶端钝，边缘膜质，具缘毛，纵脉10，粗壮，黑紫色，脉常分叉，显网状；
雌雄蕊柄短；
花瓣紫色，与花萼等长或微露出花萼，爪楔形，基部具缘毛，耳微明显，瓣片2裂，裂片顶端平截，瓣片两侧各具1齿，副花冠片舌状；
雄蕊不外露；
花柱线形。
蒴果未见。
花期7-8月。