心叶马铃苣苔，多年生无茎草本。
根状茎粗而短，直径约1.5厘米。
叶全部基生，具柄；
叶片长圆状披针形或长圆状卵形，长3-5厘米，宽1.2-2厘米，顶端钝，基部圆形，近楔形或浅心形，边缘具不规则圆齿，上面密被贴伏柔毛，下面密被淡褐色绢状绵毛，脉在两面不明显；
叶柄长达13厘米，密被淡褐色绢状绵毛。
聚伞花序2-3次分枝，2-4条，每花序具4-10花；
花序梗长达12厘米，与花梗、花萼被淡褐色腺状柔毛；
苞片无；
花梗长0.9-2毫米。
花萼5裂至近基部，裂片披针形，长2-2.5毫米，顶端微尖。
花冠细筒状，黄色，长1.9-2.2厘米，外面被腺状柔毛；
筒长1.4厘米，为檐部的2倍，直径约6毫米，喉部缢缩；
檐部二唇形，上唇2裂至中部，裂片卵形，长4毫米，宽5毫米，卞唇3裂至中部之下，裂片长圆形，长6毫米。
雄蕊分生，上雄蕊长9毫米，着生于距花冠基部3毫米处，下雄蕊长11毫米，着生于距花冠基部3.5毫米处，花丝无毛，花药宽长圆形，长约1毫米；
退化雄蕊长0.5毫米，着生于距花冠基部1.5毫米处。
花盘高2.5毫米。
雌蕊被淡褐色腺状柔毛，长1.2厘米，子房长圆形，长9毫米，花柱长约3毫米，柱头1，盘状。
蒴果披针形，长2-2.2厘米。
花期6-7月。
