密花滇紫草，多年生草本，高30-70厘米，具粗大的主根。
茎单一或数条丛生，直立，不分枝，全株密生具基盘的硬毛及短伏毛。
基生叶丛生，倒披针形或线状披针形，长8-12厘米，宽5-10毫米，先端尖；
茎中部及上部叶披针形，长5-10厘米，宽5-15毫米，上面绿色，具白斑点，下面灰白色，密生伏毛。
花序单一或分枝，顶生及腋生，集为开展或紧密的圆锥状花序；
花梗细弱，长6-10毫米，果期伸长，达15毫米；
花萼裂片线状披针形，长10-13毫米；
花冠红色或紫色，长12-17毫米，外面中部以上密生伏毛，中部以下渐少，内面裂片中肋有1列伏毛，裂片宽三角形，长约1.5毫米，宽2-2.5毫米；
花药侧面结合，长6.5-8毫米，内藏或稍伸出，花丝长约5毫米，下延部分极扩张，呈长圆状，着生花冠基部以上2-3.5毫米处；
花柱长14-17毫米，无毛；
腺体5裂，密生长柔毛。
小坚果灰褐色，具光泽，长约3毫米，有疣状突起。
花果期7-10月。
