水芹,多年生草本,高15-80厘米,茎直立或基部匍匐。
基生叶有柄,柄长达10厘米,基部有叶鞘;
叶片轮廓三角形,1-2回羽状分裂,末回裂片卵形至菱状披针形,长2-5厘米,宽1-2厘米,边缘有牙齿或圆齿状锯齿;
茎上部叶无柄,裂片和基生叶的裂片相似,较小。
复伞形花序顶生,花序梗长2-16厘米;
无总苞;
伞辐6-16,不等长,长1-3厘米,直立和展开;
小总苞片2-8,线形,长约2-4毫米;
小伞形花序有花20余朵,花柄长2-4毫米;
萼齿线状披针形,长与花柱基相等;
花瓣白色,倒卵形,长1毫米,宽0.7毫米,有一长而内折的小舌片;
花柱基圆锥形,花柱直立或两侧分开,长2毫米。
果实近于四角状椭圆形或筒状长圆形,长2.5-3毫米,宽2毫米,侧棱较背棱和中棱隆起,木栓质,分生果横剖面近于五边状的半圆形;
每棱槽内油管1,合生面油管2。
花期6-7月,果期8-9月。