黑紫灯芯草，矮小草本，高1.2-2.4厘米。
茎直立，圆柱形，直径约0.5毫米，具1条明显的纵沟槽。
叶基生；
低出叶鞘状，早枯；
基生叶1枚，线形，长约1.5厘米，顶端稍尖，下部叶鞘松弛抱茎；
无叶耳。
花单生茎顶；
苞片2枚，披针形，下面1枚叶状，长超过花的1倍，另1枚膜质，短于花；
花被片6枚，披针形，近等长，长3-4毫米，顶端渐尖或稍钝，厚纸质，黑紫色，边缘几无膜质；
雄蕊6枚，长约为花被片的1/2；
花药长圆形，长约1.5毫米，淡黄色；
花丝短，长约0.6毫米，褐色；
子房宽卵形；
花柱长1.9-2.1毫米；
柱头3分叉，长1.8-3毫米。
果未见。
花期7月。