金黄凤仙花，一年生矮小草本，高10-20厘米，茎不分枝或自基部具疏或细分枝，下部常裸露，上部被粗微毛。
叶互生，具短柄或密集于茎枝顶端，近轮生，叶片膜质，披针形或椭圆状披针形，或长圆状匙形，长4.5-7厘米，宽1.5-2厘米，顶端尖或渐尖，基部宽楔形，边缘具圆齿状锯齿，齿端具小尖，齿间具刚毛，侧脉7-9对，上面绿色，沿脉被极疏糙短毛，下面灰绿色，无毛或沿脉被微毛，中脉明显突起，上部叶近无柄，下部叶渐狭成长1.5厘米的叶柄。
总花梗细，短于叶的1/2，长2-2.5厘米，被微毛，具1-2花；
花梗长1-2厘米，果期伸长，中部或中下部具苞片；
苞片小，卵状披针形，急尖，背面具小刚毛，宿存。
花金黄色，喉部具紫褐色斑，长2-2.5厘米；
侧生萼片2，三角状卵形，长9毫米，顶端尖。
旗瓣近圆形，僧帽状，长6-7毫米，背面被微毛，基部有紫污斑；
翼瓣近无柄，长15-16毫米，2裂，基部裂片小，圆形，基部有紫色污斑，上部裂片较大，斧形或匙状斧形，顶端圆形，背部无小耳。
唇瓣长漏斗形，檐部舟状，长2厘米，基部渐狭成长2.2-2.5厘米伸长卷曲的距。
口部平展，宽6-8毫米，先端突尖。
花丝具宽翅，长3毫米；
花药顶端钝。
子房椭圆形，长3毫米，直立，顶端具明显5裂。
蒴果椭圆形，肿胀，两端尖，长1-1.5厘米。
种子多数。
花期8-9月，果期10月。
