扁穗牛鞭草，多年生草本，具横走的根茎；
根茎具分枝，节上生不定根及鳞片。
秆直立部分高20-40厘米，直径1-2毫米，质稍硬，鞘口及叶舌具纤毛；
叶片线形，长可达10厘米，宽3-4毫米，两面无毛。
总状花序长5-10毫米，直径约1.5毫米，略扁，光滑无毛。
无柄小穗陷入总状花序轴凹穴中，长卵形，长4-5毫米；
第一颖近革质，等长于小穗，背面扁平，具5-9脉，两侧具脊，先端急尖或稍钝；
第二颖纸质。
略短于第一颖，完全与总状花序轴的凹穴愈合；
第一小花仅存外稃；
第二小花两性，外稃透明膜质，长约4毫米；
内稃长约为外稃的2/3，顶端圆钝，无脉。
有柄小穗披针形，等长或稍长于无柄小穗；
第一颖草质，卵状披针形，先端尖或钝，两侧具脊；
第二颖舟形，先端渐尖，完全与总状花序轴的凹穴愈合；
第一小花中性，仅存膜质外稃，长约3.5毫米；
第二小花两性，内外稃均为透明膜质；
雄蕊3枚，花药长约2毫米。
颖果长卵形，长约2毫米。
花果期夏秋季。
