巫山淫羊藿，多年生常绿草本，植株高50-80厘米。
根状茎结节状，粗短，质地坚硬，表面被褐色鳞片，多须根。
一回三出复叶基生和茎生，具长柄，小叶3枚；
小叶具柄，叶片革质，披针形至狭披针形，长9-23厘米，宽1.8-4.5厘米，先端渐尖或长渐尖，边缘具刺齿，基部心形，顶生小叶基部具均等的圆形裂片，侧生小叶基部的裂片偏斜，内边裂片小，圆形，外边裂片大，三角形，渐尖，上面无毛，背面被绵毛或秃净，叶缘具刺锯齿；
花茎具2枚对生叶。
圆锥花序顶生，长15-30厘米，偶达50厘米，具多数花朵，序轴无毛；
花梗长1-2厘米，疏被腺毛或无毛；
花淡黄色，直径达3.5厘米；
萼片2轮，外萼片近圆形，长2-5毫米，宽1.5-3毫米，内萼片阔椭圆形，长3-15毫米，宽1.5-8毫米，先端钝；
花瓣呈角状距，淡黄色，向内弯曲，基部浅杯状，有时基部带紫色，长0.6-2厘米；
雄蕊长约5毫米，花丝长约1毫米，花药长约4毫米，瓣裂，裂片外卷；
雌蕊长约5毫米，子房斜圆柱状，有长花柱，含胚珠10-12枚。
葫果长约1.5厘米，宿存花柱喙状。
花期4-5月，果期5-6月。
