藏麻黄，小灌木，高20-60厘米，茎直立，粗壮；
茎皮灰褐色或灰黄色；
绿色小枝密集于节上成假轮生状，节间长2-3厘米，径1.5-3毫米，纵槽纹明显。
叶2裂，长约3毫米，下部约1/2以上合生，裂片宽三角形或三角状卵形，先端钝或圆，中央绿色部分窄直，周围膜质透明。
雄球花对生于节上，常2-3个组成复穗状，苞片(4-) 5-6 (-7)对，近圆形，膜质部分明显宽阔，雄花通常具8枚雄蕊，花丝全部合生，上部伸出苞片之外，假花被倒卵圆形；
雌球花对生于节上，通常单生，稀2-3个组成复穗状，无梗或有短梗，苞片2-3对，基部1/5-1/2合生，雌花2，稀1，珠被管长约0.5毫米，直立。
成熟雌球花浆果状，苞片肉质红色；
种子常露出于苞片之外，卵圆形，长约6毫米，径约3毫米，灰黑色，被白粉，边缘常有棱肋。
花期7月，种子8-9月成熟。
