那加黄堇，直立草本，高25-50厘米。
主根圆柱形，延长，上部粗约5毫米，具少数侧根和多数纤维状细根；
根茎粗壮，长2-3厘米，密盖多数叶残基。
茎1-2条，下部裸露，上部生叶和具少数分枝。
基生叶数枚，叶柄长9-17厘米，基部扩大成披针形的鞘，叶片轮廓宽卵形，长7-20厘米，宽5-16厘米，三回羽状分裂，第一回裂片4-6对，对生，下部者卵形至宽卵形，具柄，上部者长圆状狭椭圆形，无柄，第二回裂片4-5对，对生或近对生，羽状深裂或浅裂，先端钝，基部下延，边缘具圆齿状粗齿，背面具白粉，叶脉在背面隆起；
茎生叶3-5枚，疏离，互生，具短柄或近无柄，叶片长4-14厘米，宽0.2-1厘米，羽状分裂，裂片3-4对，对生，顶生者披针形，侧生者狭椭圆形，最下部1对极疏离，其余裂片沿中脉下延，边缘具不规则的粗齿，其他同基生叶。
总状花序生于茎和分枝先端，长3-6厘米，果时达8(-17)厘米，有8-10 (-18)花；
苞片狭卵形至披针形，长2-5毫米，全缘；
花梗劲直，与苞片近等长。
萼片鳞片状，近圆形，具撕裂状齿；
花瓣黄色，上花瓣长2-2.5厘米，花瓣片舟状长圆形，背部具极矮的鸡冠状突起，距圆筒形，平伸，长于花瓣片，下花瓣舟状狭倒卵形，长0.9-1厘米，先端钝，背部具矮鸡冠状突起，内花瓣提琴形，长约8毫米，花瓣片倒卵形，具1侧生囊，基部一侧具耳垂，爪线形，与花瓣片近等长；
雄蕊束长约7毫米，花药极小，花丝披针形，蜜腺体贯穿距的4/5；
子房狭椭圆形，长约2毫米，具2列胚珠，花柱长约3毫米，柱头四方形，上端2裂、具6乳突，基部两侧各具1乳突。
蒴果狭倒卵形，长1-1.3厘米，粗3-4毫米，有6-10枚种子，排成2列，成熟时自果梗基部反折。
种子圆形，直径1.5-2毫米，黑色，具光泽。
花果期7-11月。