二色唇柱苣苔，多年生草本。
根状茎圆柱形，长约4.2厘米，直径1厘米。
叶约10，均基生；
叶片纸质，狭长圆形，长4-13厘米，宽1.3-3厘米，顶端钝或微钝，基部渐狭成叶柄，边缘全缘，上面密被贴伏短柔毛，下面被白色短绒毛，侧脉每侧5-6条，不明显；
叶柄扁，长1.5-4厘米，宽3-5毫米。
花序有2花；
花序梗长约10厘米，密被短柔毛；
苞片对生，线形，长5-12毫米，密被白色短柔毛，花梗长6-12毫米。
花萼5裂达基部，裂片披针状线形，长6.5-7厘米，宽1.2-1.8毫米，顶端钝，外面密被柔毛，内面上部被极短的毛。
花冠淡紫色，长约3.6厘米，外面疏被短柔毛，内面在雄蕊之下有短柔毛；
筒漏斗状，长约2.2厘米，口部直径约2.2厘米；
上唇长约6毫米，2裂，下唇长约1.3厘米，3裂，裂片圆形。
雄蕊花丝着生于距花冠基部9毫米处，披针状线形，长约10毫米，弧状弯曲，无毛，有1条脉，花药椭圆形，长约5毫米，背面密被褐色长髯毛。
花盘环状，高约5毫米，边缘波状，被睫毛。
雌蕊长约2.5厘米，子房线形，密被柔毛，花柱被短柔毛，柱头长约3毫米，2浅裂。
花期4月。