糙叶木蓼，矮灌木，高5-10厘米，具极发达的主根。
主干粗壮；
木质枝顶端无叶，刺状，树皮灰褐色；
当年生枝细弱，密生乳头状突起，顶端生叶或花。
托叶鞘圆筒状，长4-5毫米，基部绿色，密生乳头状突起，上部膜质，顶端具2个细长的牙齿；
叶灰色至灰绿色，卵形或圆状椭圆形，长5-6毫米，宽4-5毫米，顶端钝，具短尖，基部宽楔形，渐狭为短柄，两面粗糙，均被乳头状突起，具明显的网脉。
总状花序生于当年生枝条顶端；
花梗长5-6毫米，关节位于上部；
花被片深粉红色，具白色的边缘，内轮花被片圆状肾形，长4-5毫米，宽5-6毫米，边缘全缘，微下卷，具突起的网脉，外轮花被片卵圆形，较小，果时向下反折。
瘦果卵圆形，双凸镜状，淡褐色，光亮。