木里黄芪，多年生草本，高30-60厘米。
茎多分枝，具条棱，散生白色和黑色短柔毛。
羽状复叶有11-17片小叶，长5-10厘米；
叶柄长5-15毫米，向上逐渐变短；
托叶离生，狭披针形，长5-8毫米，下面散生白色或黑色柔毛；
小叶椭圆形或长圆状卵形，长5-25毫米，宽3-8毫米，先端钝圆或微凹，基部宽楔形或近圆形，上面无毛，下面散生白色短柔毛。
总状花序稍密，有多数花，长4-7厘米；
总花梗与叶近等长或较叶长；
苞片膜质，线形，长3-5毫米，背面被白色或黑色柔毛，无小苞片；
花梗长1-3毫米，密生黑色柔毛；
花萼钟状，长约6毫米，外面密被褐色柔毛，萼齿披针形，长约为萼筒的一半，两面均被褐色柔毛；
花冠青紫色，旗瓣长圆状倒卵形，长10-13毫米，先端微凹，基部渐狭，翼瓣较旗瓣稍短，瓣片长圆形，先端钝圆，基部具短耳，瓣柄与瓣片近等长，龙骨瓣较翼瓣稍短，长7-9毫米，瓣片半卵形，瓣柄与瓣片近等长；
子房狭卵形，具柄，贴生褐色短茸毛，胚珠多数。
幼果椭圆形，两头尖，1室，果颈与萼筒近等长。
