矮獐牙菜，多年生矮小草本，高2-4厘米。
主根细，伸长，长5-7厘米，黑褐色。
茎2-5丛生，稀单生，具营养茎和花茎，直立，圆形，具条棱，基部直径约1毫米。
叶大部基生，莲座状，稍矮于茎，叶片卵形至近圆形，长4-7毫米，宽3-5.5毫米，先端圆形，下面中脉明显，基部楔形，渐狭成柄，叶柄扁平，长8-18毫米，离生；
茎生叶无柄，匙形或倒卵形，长4-6毫米，宽2.5-4毫米，先端钝，基部离生。
花单生茎顶，4数，直径8-10毫米；
花梗直立，长5-13毫米，果时伸长至20毫米；
花萼绿色，叶状，长为花冠的1/2，裂片椭圆状卵形或卵状披针形，先端钝，边缘粗糙，背面有细而明显的3-5脉；
花冠淡蓝色，裂片矩圆形，长8-10毫米，先端钝，有小尖头，基部有1个圆形腺斑；
花丝线形，长约5.5毫米，花药小，宽矩圆形，长0.9-1毫米；
子房具短柄，披针形，长约7毫米，花柱短，不明显，柱头小，2裂，裂片头状，外反。
蒴果卵状披针形，长约1厘米；
种子淡褐色，宽椭圆形，长0.7-0.8毫米，表面近光滑。
花果期8-11月。
