伊犁脬囊草，多年生草本，高50-70厘米；
根直径达3.5厘米，皮暗褐色；
根状茎圆柱状，直径4毫米，有鳞片状叶；
茎有纵条纹，有腺质短柔毛，尤其是以幼嫩部分较密，不分枝或少分枝，分枝细瘦。
叶膜质，椭圆形或卵状椭圆形，长4-8厘米，宽2-4厘米，顶端急尖或圆钝，基部截形、宽楔形或宽心形，靠叶柄急促变狭而延伸到长3-7厘米的叶柄上，全缘而稍微波状、极稀每边有1-2个三角形粗牙齿，叶脉有微柔毛，侧脉约4-5对。
花由于仅有极短的梗而聚生成顶生头状花序。
花萼漏斗状，密生腺质柔毛，长约6毫米，5浅裂，裂片三角形，长约为筒部的1/2，有缘毛；
花冠漏斗状，长约1.3厘米，直径6毫米，淡紫色，5浅裂，裂片卵状三角形，长约3毫米，顶端圆钝；
雄蕊5，插生于花冠筒中部而伸到稍超出花冠裂片的弯缺，花丝丝状，花药卵形，长1毫米，带紫色；
子房卵球状，花柱丝状，不伸出于花冠外，柱头2浅裂。
果梗长仅1-3毫米，果萼钟状，长1.3-1.6厘米，顶端直径1-1.2厘米，不显著10纵肋，疏生腺质柔毛，齿扁三角形，相等，长4毫米，顶端钝；
蒴果球状，直径5-6毫米，自近顶端盖裂。
种子肾形，桔黄色，长2.5毫米，宽1.5毫米。
花果期4-5月。
