高山厚棱芹，多年生草本，高12-20厘米。
根垂直向下，略有分叉；
根颈密被残留枯萎叶鞘。
茎多条簇生，直立，具细条纹。
基生叶具柄，柄长3-5厘米，基部略扩大成鞘；
叶片轮廓卵形至长圆状卵形，长3-5厘米，宽1-2厘米，2回羽状分裂，末回裂片线形至线状披针形，长0.5-1厘米，宽1-1.5毫米。
复伞形花序顶生，直径2-3厘米；
总苞片6-8，线形至线状披针形，有时顶端扩大以至浅裂；
伞辐10-15，长1-1.5厘米；
小总苞片8-10，披针形，长3-5毫米，边缘宽膜质，顶端常浅裂；
萼齿三角形；
花瓣白色，心状倒卵形，长1毫米，基部具短爪，先端具内折小舌片；
花柱基略呈球形，花柱2，果期向下反曲。
分生果背腹扁压，长圆形至卵状长圆形，长4-5毫米，宽约3毫米，主棱扩大成厚翅；
每槽内油管1，合生面油管2；
胚乳腹面平直。
花期7-8月，果期8-9月。
