墨脱凤仙花，一年生细弱草本，高5-20厘米。
茎纤细，平卧或斜上，下部的节膨大，具纤维状根，不分枝，稀有分枝，全株无毛。
叶膜质，互生，具柄，卵形或椭圆状卵形，长2-3.5 (5) 厘米，宽1-3厘米，顶端钝或稍尖，基部楔形，边缘具粗圆齿，齿间有小刚毛，上面绿色，下面淡绿色，侧脉5对；
叶柄长3-25毫米，基部有丝状腺体。
总花梗纤细，单生于上部叶腋，短于叶，具1-2，稀3花；
苞片小，卵状披针形，脱落。
花粉红色，长 1.5-2厘米，侧生萼片2，卵形，长约2毫米，具小尖头；
旗瓣近圆形，径6毫米，中肋背面具狭龙骨状突起，具小尖头；
翼瓣无柄，基部裂片小，近圆形，上部裂片斧形，背面具反折的狭小耳；
唇瓣狭漏斗状，口部偏斜，先端具短喙尖，向基部渐狭成内弯的距。
花药钝。
子房纺锤状，顶端具5齿裂。
花期7-8月。
