异萼假龙胆，一年生纤细草本，高1-5厘米。
主根细长。
茎直立，单一或从基部起分枝，枝丝状，常弯曲。
基生叶早落；
茎生叶具柄，叶片宽卵形或卵状矩圆形至椭圆形，长2-7毫米，宽1.5-4毫米，先端圆形或钝，基部渐狭或突然狭缩成柄，叶柄扁平，长2-5毫米。
聚伞花序顶生和腋生，多花，稀少花而近于单生；
花梗丝状，常弯曲，不等长，长达2.7厘米；
花4数，大小极不相等，上部者较茎基部分枝上者大2-4倍；
花萼长为花冠的1/2-2/3，长1.5-6毫米，深裂，裂片4，2对，异形，1对卵状椭圆形，宽约2毫米，先端渐尖，有小尖头，基部狭缩，1对狭披针形，宽约1毫米，先端渐尖，有小尖头；
花冠淡紫红色，筒状，长2.5-10毫米，分裂近中部，裂片披针形，先端急尖，有小尖头，背面有密的乳突，冠筒基部有10个矩圆形腺体；
雄蕊着生冠筒中部，花丝线形，长约1.5毫米，花药矩圆形，长约1毫米，先端具短尖头；
子房无柄，披针形，长达6毫米，先端渐尖，与花柱界限不明，柱头矩圆形，2裂。
花期10月。
