大理龙胆，一年生草本，高2-4厘米。
茎直立，黄绿色，密被乳突，从基部起分枝。
叶先端钝至渐尖，具长小尖头，边缘软骨质，上缘具乳突，下缘具睫毛，两面光滑，中脉软骨质，在下面突起，具乳突，叶柄边缘具睫毛，背面密生乳突，连合成长0.5-1毫米的筒；
基生叶大，在花期枯萎，宿存，椭圆形或卵形，长1-3.5毫米，宽6-13毫米；
茎生叶小，密集，覆瓦状排列，卵状椭圆形、椭圆形至披针形，长6-8毫米，宽2-3毫米。
花多数，单生于小枝顶端密集；
花梗黄绿色，密被乳突，长仅2-2.5毫米，连花的下部均藏于上部叶中；
花萼筒状漏斗形，长6-7毫米，萼筒膜质，外面密被细乳突，裂片披针形，长3.5-4毫米，先端急尖，具长小尖头，边缘软骨质，密被乳突，中脉软骨质，在背面作脊状突起，并向萼筒作短的下延，具乳突，弯缺膜质，截形；
花冠蓝色或白色，宽筒形或筒状漏斗形，长9-11毫米，裂片卵形，长1.5-2毫米，先端钝圆，具小硬尖，褶近半圆形，长0.8-1毫米，边缘有不整齐细齿；
雄蕊着生于冠筒下部，整齐，花丝丝状钻形，长2.5-3毫米，花药椭圆形，长0.9-1.1毫米；
子房椭圆形，长2.2-2.7毫米，两端渐狭，柄长0.8-1毫米，花柱线形，连柱头长1-1.8毫米，柱头2裂，裂片矩圆形。
蒴果内藏，倒卵形，先端圆形，有宽翅，两侧边缘有狭翅，柄短。
种子纺锤形，表面具细网纹。
花果期3-4月。
