马耳山龙胆，一年生草本，高2-10厘米。
茎直立，淡紫红色，密被细乳突，从基部起分枝。
基生叶大，在花期枯萎，宿存，卵形，长7-25毫米，宽5-14毫米，先端钝，具小尖头，边缘软骨质，有不明显的细乳突，两面光滑，叶脉1-3条，在下面稍突起，叶柄扁平，长1-2毫米；
茎生叶4-6对，外反，疏离，远短于节间，倒卵状匙形或匙形，长4-8毫米，宽1.5-5毫米，先端钝圆，有短小尖头，边缘软骨质，有不明显的细乳突，两面光滑，中脉细，在下面明显，叶柄背面具细乳突，连合成长1-1.5毫米的筒。
花多数，单生于小枝顶端，常2-5个小枝密集呈伞形；
花梗极短，淡紫红色，密被细乳突，藏于上部叶中；
花萼筒形，长6-6.5毫米，裂片狭披针形，长3-3.5毫米，先端急尖，有短小尖头，边缘膜质，狭窄，平滑，中脉细，在背面明显，弯缺狭窄，截形；
花冠淡蓝色，外面有蓝灰色宽条纹，宽筒形，长10-12毫米，裂片卵形，长1.5-2毫米，先端钝，有短小尖头，褶卵形，长1-1.5毫米，先端钝，全缘；
雄蕊着生于冠筒中部，2长3短，花丝丝状钻形，长者长2.5-3毫米，短者长1.5-2毫米，花药椭圆形，长0.7-1毫米；
子房椭圆形，长2-3毫米，两端渐狭，柄长2-2.5毫米，花柱线形，长1.5-2毫米，柱头2裂，裂片外卷，线形。
蒴果外露或内藏，宽矩圆形或倒卵状匙形，长3-4毫米，先端钝圆，有宽翅，两侧边缘有狭翅，基部渐狭，柄长至8毫米；
种子红褐色，有光泽，椭圆形，长0.8-1毫米，表面具细网纹。
花果期4-7月。
