丝萼龙胆，一年生草本，高10-12厘米。
茎紫红色或黄绿色，光滑，在基部多分枝，枝铺散，斜升。
叶先端钝圆或钝，边缘仅基部具短睫毛，其余平滑或全部平滑，两面光滑，叶脉1-3条，细，在下面明显，叶柄光滑，长1-2毫米；
基生叶大，在花期枯萎，宿存，卵圆形或匙形，长1-1.5厘米，宽0.6-1.3厘米；
茎生叶疏离，短于节间，卵形，长5-8毫米，宽3-3.5毫米。
花多数，单生于小枝顶端；
花梗紫红色或黄绿色，光滑，长10-15毫米，裸露；
花萼漏斗形，长7-9毫米，萼筒外面具深紫色短而细的条纹，裂片整齐，丝状，长3.5-4.5毫米，中脉深紫色，在背面突起，并向萼筒下延成脊，弯缺宽，圆形；
花冠淡紫红色，具多数黑紫色短而细的条纹，漏斗形，长17-20毫米，裂片卵形，长2.5-3毫米，先端钝，褶宽矩圆形，长1.5-2毫米，先端截形，啮蚀状；
雄蕊着生于冠筒中部，整齐，花丝丝状，长3.5-4毫米，花药狭矩圆形，长1.3-1.5毫米；
子房狭矩圆形，长5-7毫米，先端钝，基部渐狭，柄长2-3毫米，花柱线形，长2.5-3毫米，柱头外反，裂片线形。
蒴果内藏，稀部分外露，矩圆形，长9-10毫米，先端钝圆，具宽翅，两侧边缘具狭翅，基部钝，柄细，长至15毫米；
种子褐色，椭圆形，长1.1-1.3毫米，表面具极致密的细网纹。
花果期6-8月。