紫苞长蒴苣苔，多年生草本。
茎高11-37厘米，上部被褐色短柔毛，下部有疏柔毛或变无毛，不分枝或有短分枝。
叶对生，3-6对，具柄；
叶片草质，卵形、狭卵形或椭圆形，长3-17厘米，宽1.6-10.5厘米，顶端短渐尖或渐尖，基部圆形、宽楔形或心形，边缘有单或重锯齿，上面疏被贴伏短柔毛，下面沿脉疏被短柔毛或近无毛，侧脉每侧5-9条；
叶柄长0.3-9厘米，疏被短柔毛。
聚伞花序在茎顶腋生，2-3回分枝，有5-12花，无毛；
花序梗长4-10厘米；
苞片对生，紫色，卵形或椭圆状卵形，长3-8毫米，基部常合生；
花梗长1-5毫米。
花萼紫色，筒状钟形，长1-1.2厘米，无毛，5浅裂，浅裂片稍不等大，正三角形，长约1.2毫米，顶端微钝。
花冠紫色，长3.2-4.5厘米，无毛；
筒漏斗状，长2.9-3.3厘米，口部直径9-10毫米，基部直径3-4毫米；
上唇长约3.5-4毫米，2浅裂，下唇长9-12毫米，3浅裂，裂片宽卵形。
雄蕊的花丝着生于距花冠基部15-20毫米处，狭线形，长约10毫米，无毛，稍弧状弯曲，花药长3毫米，边缘有短柔毛；
退化雄蕊2，着生于距花冠基部12-17毫米处，狭线形，长1.5-3毫米，无毛，顶端稍变粗。
花盘杯状，高约1.6毫米。
雌蕊长2.2-2.4厘米，子房狭线形，宽0.9毫米，无毛，花柱长约5毫米，无毛或被疏柔毛，柱头近盘状，直径达1.4毫米。
蒴果长约5.5厘米，宽2毫米，无毛。
种子狭椭圆形或狭倒卵形，长约0.4毫米。
花期8-9月。
