毒芹，多年生粗壮草本，高70-100厘米。
主根短缩，支根多数，肉质或纤维状，根状茎有节，内有横隔膜，褐色。
茎单生，直立，圆筒形，中空，有条纹，基部有时略带淡紫色，上部有分枝，枝条上升开展。
基生叶柄长15-30厘米，叶鞘膜质，抱茎；
叶片轮廓呈三角形或三角状披针形，长12-20厘米，2-3回羽状分裂；
最下部的一对羽片有1-3.5厘米长的柄，羽片3裂至羽裂，裂片线状披针形或窄披针形，长1.5-6厘米，宽3-10毫米，表面绿色，背面淡绿色，边缘疏生钝或锐锯齿，两面无毛或脉上有糙毛，较上部的茎生叶有短柄，叶片的分裂形状如同基生叶；
最上部的茎生叶1-2回羽状分裂，末回裂片狭披针形，长1-2厘米，宽2-5毫米，边缘疏生锯齿。
复伞形花序顶生或腋生，花序梗长2.5-10厘米，无毛；
总苞片通常无或有1线形的苞片；
伞辐6-25，近等长，长2-3.5厘米；
小总苞片多数，线状披针形，长3-5毫米，宽0.5-0.7毫米，顶端长尖，中脉1条。
小伞形花序有花15-35，花柄长4-7毫米；
萼齿明显，卵状三角形；
花瓣白色，倒卵形或近圆形，长1.5-2毫米，宽1-1.5毫米，顶端有内折的小舌片，中脉1条；
花丝长约2.5毫米，花药近卵圆形，长约0.7毫米，宽0.5毫米；
花柱基幼时扁压，光滑；
花柱短，长约1毫米，向外反折。
分生果近卵圆形，长、宽2-3毫米，合生面收缩，主棱阔，木栓质，每棱槽内油管1，合生面油管2；
胚乳腹面微凹。
花果期7-8月。
