墨脱秋海棠，多年生草本，高30-65厘米。
根状茎和基生叶未见。
茎生叶互生，具柄；
叶片轮廓卵状披针形至椭圆状披针形，长6-9.6厘米，宽2.1-3.2厘米，先端长渐尖至尾状渐尖，基部微偏斜，圆形或微心形，边缘具有极疏的三角形小齿，上面深绿色，无毛或近无毛，脉较明显，下面黄绿色仅沿脉被褐色短柔毛，掌状3（-5)条脉，在下面呈褐色，并明显突起；
叶柄长8-24毫米，有棱，密被褐色硬柔毛；
托叶膜质，披针形，长6-10毫米，先端渐尖。
花粉红色，2-4朵，呈2-3回聚伞状，花序梗长2-3.1厘米，一次分枝长8-15毫米，花梗长5-10毫米，均近无毛或被褐色硬柔毛，小苞片和苞片膜质，长椭圆形至披针形，长5-8毫米，宽1.5-3.5毫米，先端急尖，幼时外面有褐色硬柔毛，后脱落近无毛；
雄花：花被片3，外面2片三角状卵形，长约5毫米，宽约3.5毫米，先端圆钝，外面近无毛，内面1片长圆形，长约4毫米，宽约1.5毫米；
雄蕊多数，花丝离生，长约1.5毫米，花药肾形，侧生，长约0.8毫米，雌花：花被片5，外面2片宽卵形，长约7毫米，宽约4毫米，先端钝或圆，外面无毛，内面3片长圆形至披针形，长6-7毫米，宽1.5-2毫米，先端钝至急尖；
子房长圆形，长约11毫米，宽约6毫米，外面无毛，2室，每室胎座具2裂片，具不等3翅，花柱2，基部合生，柱头2裂，膨大呈螺旋状扭曲，并带刺状乳突。
蒴果下垂，果梗长1.2-1.5厘米，无毛，轮廓长圆形，长约1.4厘米，宽约8毫米，无毛，具不等3翅，一翅特大，呈宽镰刀状，长1.5-2厘米，宽6-9毫米，先端圆，上方的边向下斜，有明显之脉，另2翅窄，长约4毫米，均无毛；
种子极多数，小，长圆形，光滑，淡褐色。
花期10-11月，果期12-1月。
