黄连山秋海棠，多年生草本。
根状茎短而粗，暗红色，具多数细长纤维状之根。
茎高0.7-1.2米，粗壮，暗红色，有棱，无毛。
叶互生或在短枝上2叶簇生，具长柄；
叶片极偏斜，轮廓卵状披针形，长5-12厘米，宽1.8-4厘米，先端尾状渐尖，基部两侧极不相等，窄侧楔形至近圆形，宽侧圆耳状，向下延伸长达8-13毫米，宽2.4-3厘米，边缘有浅而疏不等大的三角形之齿，齿尖常有短芒，上面深绿色，散生极疏硬毛，下面淡绿色，疏生短硬毛，通常掌状6条脉，窄侧2条，宽侧3条；
叶柄长3-5厘米，无毛或近无毛；
托叶膜质，披针形，长约5毫米，无毛，早落。
花粉红色，常2朵，呈聚伞状，花序梗长2.5-5厘米，花梗长8-30毫米，均无毛；
苞片膜质，长圆形，长3-4毫米，宽约1毫米，早落；
雄花：花被片4，外轮2枚宽卵形，长约8毫米，宽约6毫米，先端圆，内轮2枚长圆形，长5-8毫米，宽3.5-4（-6)毫米；
雄蕊多数，花丝离生，长1-1.5毫米，花药黄色，倒卵形，长约1毫米，药隔不伸出；
雌花：花被片5，宽卵形至长圆形，5瓣不等大，先端圆或钝；
子房倒卵长圆形，长约1毫米，宽约6毫米，无毛，3室，每室胎座具2裂片，具不等大3翅；
花柱3，离生，柱头膨大，呈外向螺旋状扭曲。
蒴果下垂，果梗长2.5-3厘米，无毛；
轮廓长圆形，长约11毫米，直径8-9毫米，无毛，具不等大3翅，最大的呈镰刀状，长1.3-2厘米，宽约1厘米，无毛，有明显网脉，另2翅小，呈斜三角形，长5-7毫米，上方的边平，下方的边从上向下斜；
种子极多数，小，长圆形，浅褐色，光滑。
花期8月，果期9-10月。
