异齿黄芪，多年生草本。
根粗壮，直伸。
茎基部分枝，高10-25厘米，被白色短伏贴柔毛；
羽状复叶有9-17片小叶，长2-4厘米；
叶柄长0.5-1.5厘米；
托叶革质，基部彼此多少合生，三角形，长2-4毫米，先端尖，下面被白色短伏贴柔毛；
小叶椭圆形至长圆形，长5-12毫米，宽2-4毫米，先端钝，基部宽楔形，上面无毛，下面被稀疏的白色短伏贴柔毛，具短小叶柄，总状花序生多数花，密集，呈头状，花序轴长1-2厘米，果期稍延伸；
总花梗比叶长；
苞片白色，膜质，披针形，长1-2毫米；
花梗短，连同花序轴密被黑色柔毛；
花萼钟状，长约3毫米，散生黑色柔毛，萼齿形状不一，下边3齿线状锥形，上边2齿狭三角形，长约为萼筒的1/2；
花冠青紫色，旗瓣倒卵状长圆形，长7-8毫米，先端微凹，基部渐狭成瓣柄，翼瓣长5-6毫米，瓣片卵形至长圆状卵形，先端钝圆，基部具短耳，瓣柄比瓣片短2-2.5倍，龙骨瓣长4-5毫米，瓣片半圆形，瓣柄长约1.5毫米；
子房被伏贴柔毛，具短柄。
荚果近球形，直径约3毫米，被白色混有黑色伏贴柔毛，具横纹。
花果期7-8月。