昌都蒿，多年生草本。
根状茎短，稍横卧；
茎多数，常成小丛，高30-40厘米，暗褐色、紫褐色或暗黑色，具纵棱，分枝多，枝长10-18厘米，具小枝；
茎、枝、小枝及叶初时被灰白色疏短柔毛或绒毛，后脱落无毛。
叶纸质，下部叶近圆形或长圆形，长1.5-2厘米，宽1-1.5厘米，二至三回羽状全裂；
中部叶近圆形或长卵形，长2-2.5厘米，宽0.5-1.5厘米，二（至三）回羽状全裂，每侧裂片4-5枚，裂片长卵形或椭圆形，长0.5-0.8厘米，宽0.4-0.6厘米，末次小裂片小，椭圆形，长3-4毫米，宽1.5-2毫米，先端尖，边反卷，中轴具狭翅，叶柄长0.4-0.7厘米，基部具半抱茎的假托叶；
上部叶与苞片叶无柄，一至二回羽状全裂。
头状花序卵形或近球形，直径1.5-2.5毫米，无梗，基部具小苞叶，在小枝上密集着生，排成短穗状花序，而在茎上组成狭窄的圆锥花序；
苞片叶3-4层，外层总苞片小，中、内层总苞片略长，卵形或长卵形，外、中层总苞片背面近无毛，有绿色中肋，边宽膜质，内层总苞片半膜质，无毛；
雌花3-5朵，花冠狭管状，檐部具2裂齿，花柱伸出花冠外，先端尖；
两性花5-10朵，花冠管状，花药线形或披针形，先端附属物长三角形，基部具小尖头，花柱线形，与花冠近等长，先端2叉，叉端截形，具睫毛。
瘦果卵形或倒卵形。
花果期8-10月。