云南蓍，多年生草本，有短的根状茎。
茎直立，高35-100厘米，下部变无毛，中部以上被较密的长柔毛，不分枝或有时上部分枝，叶腋常有不育枝。
叶无柄，下部叶在花期凋落，中部叶矩圆形，长4-6.5厘米，宽1-2厘米，二回羽状全裂，一回裂片多数，几接近，椭圆状披针形，长5-10毫米，宽2-4毫米，二回裂片少数，下面的较大，披针形，有少数齿，上面的较短小，近无齿或有单齿，齿端具白色软骨质小尖头，叶上面绿色，疏生柔毛和凹入的腺点，下面被较密的柔毛；
叶轴宽约1.5毫米，全缘或上部裂片间有单齿。
头状花序多数，集成复伞房花序；
总苞宽钟形或半球形，直径4-6毫米；
总苞片3层，覆瓦状排列，外层短，卵状披针形，长2.3毫米，宽约1.2毫米，顶端稍尖，中层卵状椭圆形，长2.5毫米，宽约1.8毫米，内层长椭圆形，长4毫米，宽约1.8毫米，顶端钝或圆形，有褐色膜质边缘，中间绿色，有凸起的中肋，被长柔毛；
托片披针形，舟状，长4.5毫米，具稍带褐色的膜质透明边缘，背部稍带绿色，被少数腺点，上部疏生长柔毛。
边花6-8(16)朵；
舌片白色，偶有淡粉红色边缘，长宽各约2.2毫米，顶端具深或浅的3齿，管部与舌片近等长，翅状压扁，具少数腺点；
管状花淡黄色或白色，长约3毫米，管部压扁具腺点。
瘦果矩圆状楔形，长2.5毫米，宽约1.1毫米，具翅。
花果期7-9月。
