水芫花,多分枝小灌木,高约1米,有时成小乔木状,高达11米;
小枝、幼叶和花序均被灰色短柔毛。
叶对生,厚,肉质,椭圆形、倒卵状矩圆形或线状披针形,长1-3厘米,宽5-15毫米;
无叶柄或叶柄仅长2毫米。
花腋生,花梗长5-13毫米,苞片长约4毫米,花二型,花萼长4 -7毫米,有12棱,6浅裂,裂片直立;
花瓣6,白色或粉红色,倒卵形至近圆形,与萼等长或更长;
雄蕊12,6长6短,长短相间排列,在长花柱的花中,最长的雄蕊长不及萼筒,较短的雄蕊约与子房等长,花柱长约为子房的2倍,在短花柱的花中,最长的雄蕊超出花萼裂片之外,较短的雄蕊约与萼筒等长,花柱与子房等长或较短;
子房球形,1室。
蒴果革质,几全部被宿存萼管包围,倒卵形,长约6毫米;
种子多数,红色,光亮,长2毫米,有棱角,互相挤压,四周因有海绵质的扩展物,而成厚翅。