微萼凤仙花，一年生草本，高20-40厘米，全株无毛。
茎纤细，直立，不分枝，下部长裸露，节间长3-7厘米叶互生，具柄，叶片卵状披针形，长3-5厘米，宽2-2.5厘米，顶端渐尖，基部尖，具1对腺体，狭成长3-10毫米的叶柄，边缘具细锯齿，齿端具小尖，侧脉4-5对，弧状弯，中脉和侧脉在下面明显，上面深绿色，下面灰绿色。
总花梗生于上部叶腋，长1-1.5厘米，直立，丝状，具2花；
花梗长10毫米，中部具苞片，基部无苞片，结果时伸长；
苞片极小，宿存。
花黄色，极小，长约1厘米；
侧生萼片2，极小，卵形，长不到1毫米，较厚，顶端突尖，一侧边缘具数齿，中肋具厚鸡冠状突起；
旗瓣扁圆形，宽10毫米，中肋背面中央具斜上的尖角；
翼瓣短，无柄，宽，长13-15毫米，2裂，基部裂片小，圆形，上部裂片反折，倒卵状圆形或半月形，背部具反折的小耳；
唇瓣檐部漏斗形或杯状，长达10毫米，口部平展，宽5毫米，先端钝，基部渐狭成长25毫米，自中部内弯的距。
花丝极短；
花药2室，顶端钝。
子房纺锤状，尖。
蒴果未见。
花期10月。