棒尾凤仙花，一年生草本，高30-60厘米。
茎粗壮，下部肿大，具多数不定根。
疏分枝，分枝纤细，下部长裸露，干时具沟槽，无毛，茎上部有少数腺体。
叶互生，具柄；
叶片薄纸质，卵状披针形或披针形，长7-12厘米，宽2-3.5厘米，顶端渐尖，基部宽楔形，边缘具圆齿状锯齿，齿间有刚毛，上面暗绿色，下面淡绿色，侧脉6-8对，不明显，两面无毛，叶柄长1-2厘米，基部具一对球形腺体。
总花梗生于上部叶腋，长于叶柄，长10-22厘米，直立，纤细，具10-12花，总状排列；
花梗长10-15毫米，结果时伸长，基部有苞片；
苞片卵形，长3-5毫米，顶端具长腺状芒尖，宿存。
花较大，淡黄色顶端带紫色，长2-2.5厘米，侧生萼片2，斜卵圆形，长4-5毫米，渐尖，具长约2毫米的腺状长芒尖，背面中肋不增厚，具多数脉，旗瓣近圆形，直径10毫米，顶端尖，背面中肋增厚具明显突尖；
翼瓣具柄，长3厘米，2裂，基部裂片近圆形，上部裂片大于基裂的2倍，渐狭，唇瓣檐部囊状，长2厘米，口部平，宽16-17毫米，先端突尖，基部渐狭成长1厘米内弯的距。
花丝宽线形，花药卵形，尖。
子房线形，急尖，蒴果线形，长2-2.2厘米，顶端喙尖。
种子少数，长约2毫米，短纺锤状。
花期7-8月，果期9月。