短茎岩黄芪，多年生草本，高约10-20厘米。
根粗壮，强烈木质化。
茎缩短，不明显，常数个近地表簇生。
叶簇生于缩短茎上，长8-15厘米，叶柄与叶轴等长；
叶轴被短柔毛；
小叶9-13，具不明显短柄；
小叶片长圆状卵形或椭圆形，长12-16毫米，宽5-7毫米，上面无毛，下面密被银灰色贴伏柔毛。
总状花序腋生，稍超出叶，总花梗和花序轴被短柔毛；
花多数，斜上升，初花时密集为卵形，长1.5-2.5厘米，花后期花序轴逐渐延伸，花的排列较疏散；
花长11-13毫米，具长约1毫米的短梗；
苞片卵状披针形，长于花梗约1倍；
萼钟状，长5-6毫米，被短柔毛；
萼齿披针状钻形，长为萼筒的1-2倍；
花冠玫瑰紫色，旗瓣倒卵形，长10-12毫米，先端圆形、微凹，基部渐狭成楔形，翼瓣线形，长为旗瓣的4/5，龙骨瓣稍短于旗瓣；
子房线形，早期几无毛或仅沿腹线被短柔毛，后期逐渐被短柔毛，胚珠3-5。
花期7-8月，果期8-9月。