活血丹，多年生草本，具匍匐茎，上升，逐节生根。
茎高10-20（30）厘米，四棱形，基部通常呈淡紫红色，几无毛，幼嫩部分被疏长柔毛。
叶草质，下部者较小，叶片心形或近肾形，叶柄长为叶片的1-2倍；
上部者较大，叶片心形，长1.8-2.6厘米，宽2-3厘米，先端急尖或钝三角形，基部心形，边缘具圆齿或粗锯齿状圆齿，上面被疏粗伏毛或微柔毛，叶脉不明显，下面常带紫色，被疏柔毛或长硬毛，常仅限于脉上，脉隆起，叶柄长为叶片的1.5倍，被长柔毛。
轮伞花序通常2花，稀具4-6花；
苞片及小苞片线形，长达4毫米，被缘毛。
花萼管状，长9-11毫米，外面被长柔毛，尤沿肋上为多，内面多少被微柔毛，齿5，上唇3齿，较长，下唇2齿，略短，齿卵状三角形，长为萼长1/2，先端芒状，边缘具缘毛。
花冠淡蓝、蓝至紫色，下唇具深色斑点，冠筒直立，上部渐膨大成钟形，有长筒与短筒两型，长筒者长1.7-2.2厘米，短筒者通常藏于花萼内，长1-1.4厘米，外面多少被长柔毛及微柔毛，内面仅下唇喉部被疏柔毛或几无毛，冠檐二唇形。
上唇直立，2裂，裂片近肾形，下唇伸长，斜展，3裂，中裂片最大，肾形，较上唇片大1-2倍，先端凹入，两侧裂片长圆形，宽为中裂片之半。
雄蕊4，内藏，无毛，后对着生于上唇下，较长，前对着生于两侧裂片下方花冠筒中部，较短；
花药2室，略叉开。
子房4裂，无毛。
花盘杯状，微斜，前方呈指状膨大。
花柱细长，无毛，略伸出，先端近相等2裂。
成熟小坚果深褐色，长圆状卵形，长约1.5毫米，宽约1毫米，顶端圆，基部略成三棱形，无毛，果脐不明显。
花期4-5月，果期5-6月。
