毛蕊龙胆，一年生草本，高2-5厘米。
茎直立，黄绿色，密被乳突，自基部起分枝。
基生叶在花期不枯萎，卵形，长4-7毫米，宽3-5毫米，先端钝，边缘软骨质，具乳突，中脉在下面明显，叶柄扁平，长1-1.5毫米；
茎生叶疏离，短于或等于节间，椭圆形至椭圆状披针形，长5-9毫米，宽1-3毫米，先端外反，急尖或渐尖，具小尖头，边缘软骨质，具短睫毛，中脉在下面突起，叶柄背面密被乳突，连合成长1-1.5毫米的筒。
花多数，单生于小枝顶端，2-4个小枝密集；
花梗黄绿色，密被乳突，长1-3毫米，藏于上部叶中；
花萼筒形，长8-10毫米，裂片开展，线状披针形或狭三角形，长3-3.5毫米，先端渐尖，具小尖头，边缘膜质，狭窄，光滑，中脉在背面突起，并向萼筒作短的下延，弯缺截形；
花冠蓝色，喉部具深蓝色短而细的条纹，筒形，长12-14毫米，裂片卵状椭圆形，长2-2.5毫米，先端钝，褶卵形，长1.5-2毫米，先端2裂或具细齿；
雄蕊着生于冠筒中部，整齐，花丝线形，长1-1.2毫米，密被糙毛，花药椭圆形，长0.8-1毫米；
子房狭椭圆形，长2.5-3.5毫米、两端渐狭柄长1-1.5毫米，花柱线形，连柱头长1-1.5毫米，柱头狭矩圆形。
花期8月。