台湾扁柏,乔木,高达40米,胸径达3米;
树冠尖塔形;
树皮淡红褐色,较平滑,裂成薄条片脱落;
枝条平展,红褐色,枝皮裂成鳞状薄片脱落。
鳞形叶较薄,先端钝尖,小枝上面之叶露出部分菱形, 长1-1.2毫米,绿色,小枝下面之叶被白粉,干时变红褐色或褐色,侧面之叶斜三角状卵形,长1-2毫米,先端微内弯。
球果圆球形,径10-11毫米,熟时红褐色;
种鳞4-5对,顶部为不规则五角形,表面皱缩,有不规则的沟纹,中央微凹,有凸起的三角状小尖头;
种子扁,倒卵圆形,两侧边缘有窄翅,稀具三棱,棱上有窄翅,红褐色,微有光泽,连翅长3-3.5毫米,宽2-3毫米。