小叶秋海棠，多年生矮小无茎草本。
根状茎球形或块状，直径约8毫米，有残存褐色的鳞片和多数细长纤维状之根。
基生叶通常2-3片，具长柄；
叶片薄，轮廓宽卵形，长2-3.4（-4）厘米，宽2-4厘米，先端圆钝，基部心形，边缘有单或重圆齿，上面黄绿色，被细毛，下面色淡，疏被细毛或近无毛，掌状5-7条脉；
叶柄柔弱，长4-6.5厘米，被细毛；
托叶膜质，卵状披针形，早落。
花葶高4.5-7厘米，极柔弱，被细毛；
花粉红色，通常2朵；
苞片倒卵长圆形或卵状三角形，长8-9毫米，先端钝，基部楔形，边缘具齿，1/2上部呈明显缺刻状齿，齿尖有短芒；
雄花：花梗长2.8厘米，柔弱，有毛；
花被片4，外轮2枚，扁圆形，长约8毫米，宽约11毫米，先端圆，基部微心形，外面有细毛，内轮2枚长圆形，长8-9毫米，宽约3.5毫米，先端圆；
雄蕊多数，花丝长1-1.5毫米，离生，花药倒卵形，长约1毫米，先端微凹，基部呈楔形；
雌花：花被片5，外轮2枚扁圆形，长约8毫米，宽约10毫米，先端圆，外面被细毛，中间1枚倒卵形，长约9毫米，宽约7毫米，先端圆，内轮2枚小，长圆倒卵形，长6-7毫米，宽2.5-4毫米，先端圆，基部楔形；
子房长圆形，长约8毫米，直径约4毫米，被细毛，：室，中轴胎座，每室胎座具1裂片；
花柱3，下部1/2 部分合生，柱头膨大，扭曲，并被刺状乳头。
果未熟，有不等大3翅，大的呈斜三角形，上方的边平，下方的边从上向下斜，另2翅窄，均被细毛。
花期9月。
