南川鼠尾草的花萼筒形，长5-7毫米，深紫色，二唇形，上唇三角形，下唇比上唇长，花期花萼长6-8毫米。
南川鼠尾草的花序为轮伞花序，2-6花，组成顶生或腋生长6-15厘米的总状花序，植株上部往往组成长达25厘米的总状圆锥花序。
南川鼠尾草是一种一年生或二年生草本植物。
紫红色