昌都耳蕨,植株高30-40厘米。
根茎直立,密生宽披针形棕色鳞片。
叶簇生,叶柄长8-13厘米,基部直径约2毫米,下部宿存,棕色,腹面有浅纵沟,下部有卵形和线形棕色鳞片,向上渐稀疏;
叶片披针形,长24-30厘米,宽3-4厘米,先端渐尖,向基部渐变狭,二回羽状深裂;
羽片24-30对,互生,平伸,无柄,三角状披针形,中部的长1.5-2厘米,宽8-10毫米,先端急尖,基部偏斜近截形,上侧有耳凸,羽状深裂;
裂片3-4 (-5)对,近对生,略斜向上,密接,矩圆形或倒卵形,上部两侧有齿;
裂片具羽状脉,腹面微凸,背面平坦。
叶为草质,背面有长纤毛状小鳞片;
叶轴禾秆色下部常带棕色,腹面有浅纵沟并有披针形及线形棕色鳞片。
孢子囊群位于羽片主脉两侧;
囊群盖圆形,盾状,边缘有齿。