会理马先蒿，根细，但有时有胡萝卜状的膨大支根。
茎单一，直立，长8-20厘米，或茎多数而侧方者上升或倾卧而后上升，很伸长，常有长枝，圆柱形，略坚硬，粗3/2-2毫米，有白色细毛。
叶基出者开花时多已不存，茎出者互生，或此处彼处地发现对生者，或全部对生，长圆形，长3/2-5厘米，宽较长少2-5/2倍，后部一直开裂到中肋，前部仅及3/2毫米，作具8-12对羽片的羽状深裂，裂片伸展，向前渐小，长圆形，钝头，有粗大或有时为重出的波状锯齿，齿常有胼胝质凸头，其缺锐，纸质，干时深绿色，上面较疏而下面主要沿脉有密毛，背面更有钙质小鳞状物与密网纹；
叶柄极短，短于叶片的5/2倍，狭而有毛。
花亚头状簇集，也有一些较疏远而腋生，苞片叶状，其中有些其下方两个羽片相距很远，具有长柄而为扇形；
花梗细而短，长公8毫米；
萼管椭圆形，长8毫米，有密而长的白毛，前方开裂至中部以下，齿5枚，有时仅3枚，叶状，柄长短不一，卵状圆形，有缺刻状锯齿；
花冠玫瑰色（由活植物上记载而来），无毛，管长15毫米，下部径5/2毫米，端径3毫米，漏斗状扩大，上唇略斜下，直立部分高4毫米，径5/2毫米，上部有收缩，盔长5毫米，以40°角前俯，宽3毫米，前方突然细缩为长4毫米下弯而端有微凹的细喙，下唇无柄，长8毫米，宽15毫米，有疏缘毛，开裂至1/2，中裂宽倒卵形，微凹头，侧裂较长1倍，宽卵状圆形；
花丝着生于管的膨大部分的基部，无毛，药长5/2毫米；
花柱无毛，略伸出。
蒴果狭卵圆形，很尖锐，与萼等长。
花期8-9月。