花叶海棠是被子植物门蔷薇科苹果属的植物。
花叶海棠，灌木至小乔木，高可达8米；
小枝细长，圆柱形，嫩时密被绒毛，老枝暗紫色或紫褐色；
冬芽小，卵形，先端钝，密被绒毛，暗紫色，有数枚外露鳞片。
叶片卵形至广卵形，长2.5-5厘米，宽2-4.5厘米，先端急尖，基部圆形至宽楔形，边缘有不整齐锯齿，通常3-5不规则深裂，稀不裂，裂片长卵形至长椭圆形，先端急尖，上面被绒毛或近于无毛，下面密被绒毛；
叶柄长1.5-3.5厘米，有窄叶翼，密被绒毛；
托叶叶质，卵状披针形，先端急尖，全缘，被绒毛。
花序近伞形，具花3-6朵，花梗长1.5-2厘米，密被绒毛；
苞片膜质，线状披针形，具毛，早落；
花直径1-2厘米；
萼筒钟状，密被绒毛；
萼片三角卵形，先端圆钝或微尖，全缘，长约3毫米，内外两面均密被绒毛，比萼筒稍短；
花瓣卵形，长8-10毫米，宽5-7毫米，基部有短爪，白色；
雄蕊20-25。
花丝长短不等，比花瓣稍短；
花柱3-5，基部无毛，比雄蕊稍长或近等长。
果实近球形，直径6-8毫米，萼片脱落，萼洼下陷；
果梗长1.5-2厘米，外被绒毛。
花期5月，果期9月。
在陕西北部不再采用花叶海棠作苹果砧木的原因是其植株容易患锈果柄。
花叶海棠的模式标本采自甘肃东部。
花叶海棠的学名是Malus transitoria (Batal.) Schneid.
花叶海棠在植物分类学报第5卷中有记载。
花叶海棠的花期是5月，果期是9月。
花叶海棠通常生长在山坡丛林中或黄土丘陵上，海拔1500-3900米。
花叶海棠主要分布在中国的内蒙古、甘肃、青海、陕西、四川等地。
花叶海棠的变种与原变种的主要区别在于果实的形状，变种的果实长圆椭圆形或长圆卵形，而原变种的果实近球形。
花叶海棠的冬芽小，卵形，先端钝，密被绒毛，暗紫色，有数枚外露鳞片。
根据记载与图片观察，M. setok Vass. 可能为花叶海棠的近缘种或生态类型。
花叶海棠的果实近球形，直径6-8毫米。
花叶海棠的托叶叶质，卵状披针形，先端急尖，全缘，被绒毛。
花叶海棠与变叶海棠的区别在于花叶海棠的植株比较矮小，树皮较厚，枝条、叶片下面、花梗和萼筒都密被绒毛，叶片深裂，花和果实形状都比较小。
花叶海棠的叶片卵形至广卵形，长2.5-5厘米，宽2-4.5厘米，先端急尖，基部圆形至宽楔形，边缘有不整齐锯齿，通常3-5不规则深裂，稀不裂。
青海地区以花叶海棠的叶子代茶。
白色
5月
