藏珍珠菜，二年生或多年生草本。
根簇生，稍坚硬。
茎直立，高达37厘米，淡褐色，稍具棱，被无柄腺体，常自基部发出长分枝。
基生叶早凋；
茎叶互生，下部的阔卵形，中部的较狭，上部的卵状披针形，通常长约3.3厘米，宽1.7厘米，先端锐尖，基部楔形，下延，边缘微呈皱波状，有不规则的红色腺点，草质，上面暗绿色，下面带粉绿色，被粉末状腺体；
叶柄长约1厘米，具狭翅。
总状花序生于茎端和枝端，圆柱状，长约9厘米，宽2.8厘米，顶端花密集，成圆形；
苞片钻状披针形，长达5毫米，边缘膜质；
花梗纤细，长达6毫米；
花萼长约5毫米，分裂近达基部，裂片披针形，长4毫米，宽约1.2毫米，先端长渐尖而顶部稍钝，边缘膜质，常具小齿，背面有粗腺条；
花冠白色或略染红色，长达1厘米，5深裂，裂片长圆形，长约6.5毫米，宽约2毫米，顶端微具小圆齿，基部具不明显的爪，裂片间的弯缺成锐角；
雄蕊与花冠等长，花丝贴生于花冠裂片上；
子房球形，无毛；
花柱稍粗，长达5毫米，花蕾期不伸出花冠外。
未成熟蒴果球形，直径3.5毫米。
