商南蒿，一、二年生草本。
主根单一，垂直，狭纺锤状。
茎单生，高80-150厘米，纵棱明显，多分枝，开展，长可达30厘米，茎、枝被淡黄色或灰黄色短柔毛。
叶初时两面被淡黄色或灰黄色短柔毛，后渐稀疏；
基生叶与茎下部叶卵圆形，（二至）三回羽状深裂，花期凋谢；
中部叶卵形或长卵形，长10-12厘米，宽6-8厘米，二至三回羽状分裂，第一回全裂，每侧有裂片3-4枚，裂片椭圆形或长卵形，长4-5厘米，宽2-3厘米，第二、三回为深裂齿或为宽栉齿，每侧3-4枚，有时裂齿边缘具数枚小栉齿，叶柄长2-3（-4）厘米，基部有半抱茎的假托叶；
上部叶一至二回羽状深裂；
苞片叶3-5深裂或不分裂，而为椭圆状披针形。
头状花序大，半球形或近球形，直径5-7毫米，具短梗，下垂，基部有小苞叶，在分枝上6-10枚排成总状花序或近于穗状花序，而在茎上组成开展的圆锥花序；
总苞片3-4层，内、外层近等长，外层总苞片长卵形，背面有绿色中肋，疏被灰黄色的短柔毛，边宽膜质，中层总苞片卵形，背面近无毛，边宽膜质，内层总苞片长椭圆形，半膜质或膜质，无毛；
雌花1(-2)层，15-20朵，花冠狭管状或狭圆锥状，檐部具2-3裂齿，花柱略伸出花冠外，先端2叉，叉端钝尖；
两性花80-150朵，中央少数花不孕育，花冠管状，花药线形，上端附属物尖，长三角形，基部有短尖头，花柱线形，与花冠等长或稍长于花冠，先端2叉，叉端截形，有短睫毛。
瘦果倒卵形或椭圆形，果壁上有细纵纹。
花果期8-10月。
