二花蝴蝶草，一年生草本，全体疏被极短的硬毛。
茎长17-50厘米，简单或基部分枝，匍匐或上升，下部节上生根。
叶具长6-10毫米之柄；
叶片卵形或狭卵形，长2-4厘米，宽1-2.5厘米，基部钝圆或稀为宽楔形，先端急尖或短渐尖，边缘具粗齿。
花序着生于中、下部叶腋，由于花序顶端的一朵花不发育，而使发育的花通常排成二歧状；
发育的花通常2朵，罕为4朵；
苞片三角状钻形或条形，长约3毫米；
花梗长5-8毫米，果期长6-12毫米，与苞片同疏被短毛；
萼筒状，先端稍扩大，长约1厘米，果期长约1.2厘米，具5枚不等宽的翅，翅宽0.5-1毫米；
萼齿5枚，狭披针形，先端渐尖，长3-4毫米；
花冠黄色，稀白色而微带蓝，长约11毫米；
前方2枚花丝基部各有1长约3毫米而多少棍棒状的附属物；
花柱顶端扩大，具2枚钝圆的裂片，花的各个部分除萼的外面疏被短毛外均无毛。
蒴果长椭圆体状，长约7毫米，宽约3毫米。
花果期7-10月。
