小裂叶荆芥，一年生草本。
茎高13-26厘米，通常自最基部分枝，分枝常较主茎为短，有时与之近等长，但顶部均具花序，茎、枝均钝四棱形，棱上常浅紫褐色，在茎下部则全为紫红色，被白色疏柔毛。
叶片宽卵形至长圆状卵形，长1-2.3厘米，宽0.7-2.1厘米，二回羽状深裂，裂片线状长圆形至卵状长圆形，全缘或少数具1-2齿，先端钝或圆形，草质，上面橄榄绿色，被白色疏柔毛，下面色稍浅，被较密的白色疏柔毛，两面均偶见黄色树脂腺点；
茎枝下部的叶柄与叶片等长或超过之，上部的叶柄较短。
花序为多数轮伞花序组成的顶生穗状花序，被白色疏柔毛，长（1）2-8厘米，径1.2-1.4厘米，生于主茎上的较长，生于侧枝上的较短；
位于穗状花序上部的轮伞花序连续，下部的则间断，具4-10花；
穗状花序下方的1-2对苞叶大，与茎叶近似，但向上渐变小，由羽状深裂至全缘而呈线状披针形，渐尖，约与萼等长，苞片线状钻形，小；
花梗长1-4毫米。
花萼长5-6毫米，径3.5毫米，外被白色疏柔毛，内面无毛，喉部斜向，具15脉，于齿间湾缺处2脉相会成结，自结再分为二叉，沿齿边缘向上至齿端会合成一短芒尖，齿5，卵形，后3齿长约1.8毫米，前2齿较小，齿边缘均干膜质。
花冠淡紫色略超过花萼，长6.5-8毫米，外面被具节长柔毛，内面无毛，冠筒长5-6毫米，向上渐扩大，冠檐二唇形，上唇短，直立，浅2圆裂，下唇3裂，中裂片较大，先端微凹，基部爪状变狭，边缘具不规则的齿缺，侧裂片较小。
雄蕊4，后对略超出上唇。
花柱先端近相等2浅裂。
小坚果长圆状三棱形，长1.7-2毫米，宽0.8-1毫米，褐色，顶端圆形，微被小毛或无毛，基部急尖。
花期6-8月，果期8月中旬以后。
