异色线柱苣苔，小亚灌木。
茎高25-45厘米，顶部密被淡黄色贴伏柔毛，下部变无毛。
叶互生，或有时下部叶多少对生；
叶片纸质或草质，长圆状倒披针形、长圆形或狭椭圆形，长6.5-16厘米，宽2.5-5厘米，顶端微尖，基部渐狭，边缘有不规则小牙齿，上面被贴伏柔毛，变无毛，下面被柔毛，沿脉毛较密，侧脉每侧7-12条，上部的与中脉成锐角向斜上方展出；
叶柄长0.7-2.5厘米。
聚伞花序单生叶腋，长4-6厘米，2-3回分枝，有10-25花；
花序梗长1.8-3厘米，与苞片及花梗等均密被淡黄色贴伏柔毛；
苞片披针形，长5-8毫米；
花梗长1-4毫米。
花萼5裂达基部，裂片线形，长约5毫米，外面密被贴伏柔毛，内面无毛。
花冠白色，无毛；
筒长约1毫米，上唇长约3毫米，2深裂，下唇与上唇近等长，3深裂，裂片长圆形，顶端圆形。
雄蕊无毛，花丝着生于花冠基部之上，比花药长，花药卵球形；
退化雄蕊极小。
雌蕊长约3.5毫米，子房卵球形，有极短的毛。
浆果卵球形，长约5毫米，有短毛。
花期6-8月。
