珠叶凤尾蕨，植株矮小，高10-15厘米。
根状茎短而直立，粗3-4毫米，先端被浅褐色鳞片。
叶二型；
柄纤细，长6-8厘米（不育叶的柄稍短），粗不及1毫米，浅禾秆色，光滑；
能育叶片三角形，长5-10厘米，宽3-5厘米，二至三回羽状；
羽片约7对，互生或近对生，下部的相距2.5厘米，开展，基部一对具柄（长6毫米），长卵形，长约4厘米，宽约2厘米，二回羽状；
小羽片约3对，稍斜向上，末回小羽片长圆披针形，长7-9毫米，宽2-2.5毫米，钝头，基部阔楔形，全缘；
向上的羽片渐变单一，无柄；
不育叶片略较短，羽片及小羽片同形但较宽，叶缘有尖齿。
主脉明显，暗绿色，侧脉不明显，单一或分叉。
叶干后草质，褐绿色，无毛；
叶轴及羽轴暗绿色，其上部均有狭翅。