云南朱兰，植株高（2-) 5-9（-12)厘米。
根状茎短，生数条细长的根。
茎直立，在中部以上具枚叶。
叶稍肉质，近椭圆形，长1-3（-4.5)厘米，宽（4-）7-15（-20）毫米，先端急尖，基部收狭，抱茎。
花苞片叶状，狭椭圆形、狭卵形或狭卵状披针形，长5-17 (-20)毫米；
花梗和子房长5-8 (-15)毫米；
花单朵顶生，紫色或粉红色，不甚张开；
萼片狭长圆形，长1.4-1.7厘米，宽2.5-3毫米，先端急尖；
花瓣近狭倒卵状长圆形，与萼片近等长，宽3.5-4毫米，先端钝；
唇瓣近狭长圆形，一般略短于萼片，长1.3-1.5厘米，向基部略收狭，在中部以上3裂；
侧裂片狭长，肩状；
中裂片近线形，约占唇瓣全长的2/5，边缘具不规则齿缺，上面布满鸡冠状突起；
唇盘上有2条纵脊，从基部延伸至中裂片基部，彼此靠合而形成肥厚的脊状物；
蕊柱近直立或稍向前弯曲，长6-8毫米。
蒴果直立，倒卵状椭圆形，长1-1.2厘米，宽3.5-6毫米。
花期6-7月，果期10月。
