高山捕虫堇，多年生草本。
根多数，粗0.4-1毫米。
叶3-13，基生呈莲座状，脆嫩多汁，干时膜质；
叶片长椭圆形，长1-4.5厘米，宽0.5-1.7厘米，边缘全缘并内卷，顶端钝形或圆形，基部宽楔形，下延成短柄，上面密生多数分泌粘液的腺毛，背面无毛，两面淡绿色，侧脉每边5-7条。
花单生。
花梗1-5条，长2.5-13厘米，粗0.4-1.2毫米，上部于结果时增粗，无毛。
花萼2深裂，无毛；
上唇3浅裂，裂片卵圆形，花期长2-3毫米，果期长2.5-4毫米，下唇2浅裂，裂片卵形，花期长1-1.5毫米，果期长1.5-2.5毫米。
花冠长9-20毫米，白色，距淡黄色；
上唇2裂达中部，裂片宽卵形至近圆形，长2-4.5毫米，宽2-4.5毫米，下唇3深裂，中裂片较大，圆形或宽倒卵形，顶端圆形或截形，长3-8毫米，宽4-8毫米，侧裂片宽卵形，长1.5-5毫米，宽2-6毫米；
筒漏斗状，长3-7毫米，口直径5-10毫米，外面无毛，内面具白色短柔毛；
距圆柱状，长3-6毫米，中部粗2-2.5毫米，顶端圆形。
雄蕊无毛；
花丝线形，弯曲，长1.4-1.6毫米；
药室顶端汇合。
雌蕊无毛；
子房球形，直径约1.5毫米；
花柱极短；
柱头下唇圆形，宽约1.8-2毫米，边缘流苏状，上唇微小，狭三角形。
蒴果卵球形至椭圆球形，长5-7毫米，宽2.5-5毫米，无毛，室背开裂。
种子多数，长椭圆形，长0.6-0.8毫米，种皮无毛，具网状突起，网格纵向延长。
花期5-7月，果期7-9月。
